Otázka:
Co je to operon?
Salvator
2014-12-29 19:48:24 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Co je to operon v eukaryotické buňce a jak reguluje expresi genů? Wikipedii jsem již četl, ale není mi to dostatečně jasné. Moje znalosti v genetice jsou bohužel velmi špatné!

Můžete se podívat na [Encyclopedia Britannica] (http://www.britannica.com/EBchecked/topic/429974/operon).
U much a červů se vyskytují některé přirozeně se vyskytující polycistronické mRNA. Umělou polycistronickou DNA můžete také vyrobit pomocí míst IRES nebo samoštěpících 2A peptidových sekvencí (které byly izolovány z virů). Na kterou se ptáte?
Je operon jen několik genů se stejnou regulací, takže jsou přepisovány současně? U prokaryot jsou geny v operonu často umístěny vedle sebe, takže je lze přepsat jako jednu mRNA a využít jejich schopnosti překládat polycistronickou mRNA, ale u eukaryot, kde jsou polycistronické mRNA méně časté, nemusí být blízko navzájem v genomu.
@Superbest: Ptám se na přirozeně se vyskytující polycistronické mRNA
Jeden odpovědět:
Chris
2014-12-30 02:03:28 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Operony se kdysi považovaly pouze za prokaryoty (a viry prokaryot), ale v současnosti je známo, že v eukaryotických organismech existuje celá řada příkladů. Většinou se vyskytují u hlístic a hmyzu.

Operon je obecně funkční jednotka DNA, která obsahuje shluk genů, které jsou regulovány jedním promotorovým / represorovým prvkem a které jsou přepisovány společně. Jedná se o geny, které fungují společně v úzkém kontextu. Dobrým příkladem je lac operon v bakteriích.

U prokaryot vede exprese operonu k polycistronické (více otevřených čtecích rámců na stejném transkriptu) mRNA, která je poté přeložena do proteinů.

Operony v eukaryotech jsou také genové shluky (často funkčních blízce příbuzných proteinů), které jsou regulovány jednou regulační jednotkou (promotorem). Viz obrázek 1 z odkazu 1:

enter image description here

Existují různé způsoby mRNA vyplývající z tohoto jevu. Nejprve mRNA může být dicistronická a nejpravděpodobněji má vnitřní ribozomální vstupní místa (IRES), která umožňují iniciaci (nebo opětovnou iniciaci) translace druhého genu. Další možností je štěpení primárního řetězce mRNA na dvě (nebo více) monocistronických mRNA. A konečně je také možné, že dicistronický přepis je alternativně sestříhán, aby získal různé (monocistronické) mRNA.

Pokud vás zajímají podrobnosti o eukaryotických operonech, důrazně doporučuji přečíst alespoň první odkaz (a pravděpodobně také navazuje na některé související citace (vpravo na webu NIH)).

Odkazy:

  1. Blumenthal, T. (2004). Operony v eukaryotech. Briefings in Functional Genomics, 3 (3), 199-211.
  2. Pi, H., Lee, L. W., & Lo, S. J. (2009). Nové poznatky o polycistronických přepisech v eukaryotech. Chang Gung Med. J, 32, 494-498.
Jedním z nejlepších příkladů eukaryotických operonických RNA mohou být miRNA produkované z klastrů. Vznikají ze stejného primárního přepisu.
Jelikož se OP konkrétně ptá na eukaryotické operony a zdá se, že rozumí prokaryotickým, je možné přinejmenším také zahrnout schéma eukaryotického? Papír Fly Adh / Adhr má jednoduchou postavu, ale neměl jsem čas si ho důkladně přečíst.
+1 za použití příkladů c elegans a drosophila ve vaší odpovědi


ⓘ
Tyto otázky a odpovědi byly automaticky přeloženy z anglického jazyka.Původní obsah je k dispozici na webu stackexchange, za který děkujeme za licenci cc by-sa 3.0, pod kterou je distribuován.
Loading...