Otázka:
Mají všechny prokaryoty ATP syntázy a elektronový transportní řetězec?
Gabriel
2016-04-22 04:10:18 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Hledal jsem to a zajímalo by mě, jestli zatím mám pravdu v následujících věcech:

  • Většinou eukaryoti dělají aerobní dýchání, které zahrnuje glykolýzu, Krebsův cyklus a oxidační fosforylace zahrnující ATP syntázu a ETC
  • Prokaryoty mohou buď provádět aerobní dýchání, anaerobní dýchání nebo fermentaci, přičemž první dva vyžadují ETC a ATP syntázy, které by byly umístěny v plazmatické membráně prokaryote

Pokud tomu tak je, zajímalo by mě, jestli existují prokaryoty, které pouze fermentují, a pokud ano, mají ATP syntázy a ETC? Jinými slovy, existují nějaké organismy bez ATP syntáz a ETC (které by je přinutily přežít pouze při fermentaci, pokud neexistuje nějaký jiný způsob výroby energie u prokaryot, který nepoužívá ATP syntázy a ETC, že jsem chybí)?

Díky

Tři odpovědi:
David
2016-04-23 02:29:31 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Toto je zajímavá otázka (myslím to opravdu - viz níže), u níž je na webu pozoruhodně obtížné najít přímou odpověď. Když jsem si to prohlédl, dostal jsem stránky s tvrzeními, které uvádějí, že anaerobní bakterie mají stále elektronový transportní řetězec (ETC) a ATP syntázu, protože existují jiné akceptory elektronů než kyslík. Ano, víme, že věci se liší v tepelných otvorech a horkých pramenech, ale co plynová gangréna? Nejsem mikrobiolog, ale před několika lety jsem si pro biochemickou bioinformatickou laboratoř hrál s metabolismem některých bakterií, takže mohu uvést dva případy, kdy se zdá, že anaerobním bakteriím chybí ETC nebo ETC a ATP syntáza.

Clostridium perfringens

Toto je anaerobní fermentující bakterie, která vede k plynové gangréně v infikovaných ranách a byla hlavní příčinou ztráty končetin a úmrtnosti v první světové válce . Byla stanovena DNA sekvence Clostridium perfringens. Cituji zdlouhavě článek, který popisuje fermentaci, ale kurzíva klíčového prohlášení pro ty, kteří to chtějí přeskočit:

Nenašli jsme žádné geny kódující kyselinu trikarboxylovou ( TCA) proteiny související s cyklem nebo dýchacím řetězcem , na rozdíl od C. acetobutylicum, které má neúplné enzymy TCA cyklu. Podobně jako u C. acetobutylicum bychom mohli vytvořit mapu cest pro anaerobní fermentaci vedoucí k produkci laktátu, alkoholu, acetátu a butyrátu, které byly běžně detekovány v kulturách C. perfringens. Ve fermentační cestě je pyruvát přeměňován na acetyl-CoA pyruvát-ferredoxin oxidoreduktázou (CPE2061), čímž vzniká plynný CO 2 a redukovaný ferredoxin. Elektrony ze sníženého ferredoxinu jsou přenášeny na protony pomocí hydrogenázy (CPE2346), což vede k tvorbě molekul vodíku (H .

Příbuzná bakterie, Clostridium acetobutylicum, uvedená v extraktu, je také obligátním anaerobem. (Fermentuje různé rostlinné mono- a polysacharidy na aceton, butanol a ethanol - používané k výrobě výbušnin v první světové válce.) Ačkoli má některé enzymy cyklu TCA, není schopen tento cyklus použít oxidačně a stejně jako Clostridium perifringens postrádají enzymy transportního řetězce elektronů a ATP syntázu.

Ureaplasma urealyticum (Ureaplasma parvum)

Tento mikro- organismus je spíše mikroskopem (Mollicute) než bakterií - tj. postrádá buněčnou stěnu. Infikuje lidský urogenitální trakt. Postrádá komponenty řetězce přenosu elektronů, ale má funkční ATP syntázu. Vytváří gradient vodíkových iontů, nikoli zvýšením koncentrace vodíkových iontů v mezimembránovém prostoru oxidací NADH v ETC, ale snížením koncentrace intracelulárních vodíkových iontů generováním amoniaku z močoviny (hojně v jejím prostředí) reakce katalyzovaná ureázou, kterou kóduje. Sekvenci organismu a odkazy na předchozí práci na jeho ureázové aktivitě najdete zde.

Evoluční úvahy

Důvod, proč považuji tuto otázku za zajímavou, je, že anaerobní organismy předcházely aerobním organismům, takže vyvstává otázka, zda existují nějaké současné anaerobní bakterie, které se vyvinuly z těchto prvotních anaerobů a nikdy neměly elektronový transportní systém - nebo zda všechny současné anaerobní organismy postrádají ETC odvozené od organismů s ETC (aerobní nebo s použitím jiného akceptoru elektronů) a právě tyto funkce ztratily nepoužíváním (jak je nejpravděpodobnější v příkladech výše)? Tuto otázku určitě museli zvážit ti v oboru.

Velmi hezké! Tyto organismy jsou velmi zajímavé.
Ano. Také mi připadají fascinující.
István Zachar
2016-08-06 21:54:20 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Ano, existují, i když jsem je musel hodně kopat, abych je našel. Říká se jim přísně fermentující bakterie .

Bakterie mléčného kvašení (Lactobacillales (Firmicutes)) fermentují glukózu prostřednictvím pyruvátu na laktát pomocí glykolytické dráhy a zahrnují rody Streptococcus , Lactococcus , Lactobacillus a Leuconostoc.

Od Madigan a kol. 2014 Brock biologie mikroorganismů, 14. vydání ( PDF):

s. 66.

"Mikrobiální eukaryota, která obsahují hydrogenosomy, provádějí přísně fermentační metabolismus. Mezi příklady patří lidský parazit Trichomonas (oddíly 17.3 a 32.4) a různí protisti, kteří obývají bachor přežvýkavců (oddíly 1.5 a 22.7) nebo anoxické bahno a jezerní sedimenty. “

str.93.

„ Reverzibilita ATPázy vysvětluje proč přísně fermentační bakterie, které postrádají transportní řetězce elektronů a nejsou schopné provádět oxidační fosforylaci, stále obsahují ATPázy. Mnoho důležitých reakcí v buňce, jako je bičíková rotace a některé formy transportu, je spojeno spíše s energií z PMF než přímo z ATP. ATPáza organismů neschopných dýchat, jako jsou přísně fermentující bakterie mléčného kvašení, tedy funguje jednosměrně a generuje tento požadovaný pmf z ATP vytvořeného během fosforylace na úrovni substrátu ve fermentaci. “

Tri chomonas (Excavata) je eukaryot.

Nejsem žádný odborník, ale dívám se na angličtinu. Výrok „„ přísně fermentační bakterie, které postrádají řetězce transportu elektronů “<- neuvádí, že všechny přísně fermentující bakterie postrádají řetězec transportu elektronů, a nestanoví to fermentačním bakteriím chybí elektronový transportní řetězec. Když řeknu „ptáci, kteří mají dlouhé nohy“, naznačuje to, že mohou existovat ptáci, kteří nemají dlouhé nohy.
To znamená, že vidím, jak snad přísně fermentující bakterie nemají ETC (možná by to znamenalo, že měli ETC, ale nikdy jej nemohli použít, což by bylo možná divné). Ale jakkoli se může stát, že žádný nemají, citovaný text neříká, že žádný nemají.
Dunois
2020-05-03 12:56:52 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Toto je velmi pozdní odpověď, ale mnoha mykoplazmům chybí většina hlavních metabolických cest kromě glykolýzy; takže žádný transportní řetězec elektronů a žádný trikarboxylový cyklus ( viz Pollack et a. 2002).



Tyto otázky a odpovědi byly automaticky přeloženy z anglického jazyka.Původní obsah je k dispozici na webu stackexchange, za který děkujeme za licenci cc by-sa 3.0, pod kterou je distribuován.
Loading...