Otázka:
Je možné vytvořit novější zvířecí model zcela založený na bioinformatických studiích?
Devashish Das
2016-12-06 03:58:58 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Chtěl jsem vědět, jestli je možné dokázat nový organismus jako zvířecí model pro jakékoli lidské onemocnění pouze pomocí bioinformatických metod, jako jsou NGS a strukturní bioinformatika.

Například řekněme, že Drosophila je zvířecí model pro Disease X , protože má určitou 60-70% podobnost v genové a proteinové struktuře. Můžeme dokázat, že novější organismus je lepším modelem pro X , pokud vykazuje vyšší podobnost, řekněme 80–85%, s genovou a proteinovou strukturou člověka?

AKTUALIZACE (Nejprve jsem to zveřejnil jako komentář! Ale myslím, že to se sem hodí nejlépe!)

@David: Děkujeme za vaši odpověď! Vlastně jsem se na to podíval, Velké zvířecí modely vzácných genetických poruch: ovce jako fenotypicky relevantní modely lidské genetické choroby. Mám větší zájem o výpis problémů, pokud zahájíme tento druh projektu v naší laboratoři. Do NGS je řešení, nebo na jakou část biologie se musíme zaměřit, abychom byli přesnější.

Obecný problém predikce účinků [variace] sekvence na fenotyp není zdaleka vyřešen, takže bych řekl ne. Ale přesto by to mohl být povzbudivý signál k pokusům o nový organismus.
Jeden odpovědět:
David
2016-12-06 04:38:17 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Je naivní si myslet, že rozsah podobnosti bílkovin je dostatečný k určení, jaký je nejlepší zvířecí model pro lidskou nemoc. Fyziologie zvířete a otázka kompenzačních genů jsou faktory, které k tomu přispívají.

Pokud je protein funkčně podobný, může být irelevantní, pokud se odlišoval v jiných oblastech. A samozřejmě existují etické a nákladové úvahy - zvířata nejblíže člověku jsou lidoopi!

Navrhuji, abyste prozkoumali literaturu na toto téma. Není to můj obor, ale společnost Google přinesla tento příspěvek pojednávající o modelech pro onemocnění ledvin a vy byste nepochybně mohli najít mnohem víc sami.



Tyto otázky a odpovědi byly automaticky přeloženy z anglického jazyka.Původní obsah je k dispozici na webu stackexchange, za který děkujeme za licenci cc by-sa 3.0, pod kterou je distribuován.
Loading...